ГАЗ-3309 имеет рамную конструкцию с цельнометаллической 2-местной 2-дверной кабиной и металлической платформой, имеющей три откидных борта для облегчения и ускорения погрузки и разгрузки.
Кабина автомобиля оборудована системами отопления и вентиляции, обеспечивающими высокий комфорт водителю в различных климатических зонах. Сиденья для пассажиров и водителя — раздельные, оборудованы ремнями безопасности.
На автомобиль устанавливаются рядные 4-х и 6-ти цилиндровые дизельные двигатели жидкостного охлаждения.